A análise de água do município de Joanópolis é realizada semanalmente pelo Serviço de Vigilância Sanitária. Esta análise ajuda a prevenir uma série de doenças causas pelo consumo de água contaminada.
A grande maioria destas enfermidades estão relacionadas com a presença de microrganismos encontrados em reservatórios de água doce, contaminadas principalmente por via fecal.
A forma de contaminação mais comum é a ingestão de água contaminada ou o consumo de alimentos previamente higienizados por ela.
Análise de água realizada pela Vigilância Sanitária estuda ainda padrões de potabilidade para sistemas de abastecimentos de água, promovendo ações para garantir a qualidade da água que chega até a população.